Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms