Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIRT3Q9NTG7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIRT3Q9NTG7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms