Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MMP26Q9NRE1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MMP26Q9NRE1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms