Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TIMMDC1Q9NPL8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms