Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMG20AQ9NP66 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HMG20AQ9NP66 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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