Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCCC2Q9HCC0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCC2Q9HCC0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms