Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLSPNQ9HAW4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms