Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LINC00597Q9H2U6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC00597Q9H2U6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms