Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NYXQ9GZU5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NYXQ9GZU5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms