Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C20orf27Q9GZN8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C20orf27Q9GZN8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C20orf27Q9GZN8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C20orf27Q9GZN8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C20orf27Q9GZN8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms