Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms