Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RIOK2Q9BVS4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RIOK2Q9BVS4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms