Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP58Q9BVL2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP58Q9BVL2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms