Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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NDUFAF3Q9BU61 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NDUFAF3Q9BU61 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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