Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PAGR1Q9BTK6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAGR1Q9BTK6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms