Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NIPSNAP1Q9BPW8 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NIPSNAP1Q9BPW8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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