Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITX2Q99697 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms