Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGD4Q96M96 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms