Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms