Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGLYRP3Q96LB9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms