Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00208Q96KT6 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
LINC00208Q96KT6 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms