Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM12Q96EX1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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