Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SIRT1Q96EB6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIRT1Q96EB6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms