Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF501Q96CX3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF501Q96CX3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms