Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPTSSAQ969W0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms