Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms