Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms