Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIPC3Q8TF64 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms