Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATL2Q8NHH9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATL2Q8NHH9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms