Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf106Q8NAJ2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf106Q8NAJ2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf106Q8NAJ2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf106Q8NAJ2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf106Q8NAJ2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms