Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATG16L2Q8NAA4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms