Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM71DQ8N9W8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms