Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2AFVQ71UI9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms