Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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USP53Q70EK8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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USP53Q70EK8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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USP53Q70EK8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
USP53Q70EK8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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