Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEM1Q6ZVN7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEM1Q6ZVN7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms