Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms