Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HACD2Q6Y1H2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HACD2Q6Y1H2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms