Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SFT2D1-202ENST00000478705 659 ntTSL 214.28□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 A2M-213ENST00000546069 593 ntTSL 55.19□□□□□ -1.583e-21■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 57.32□□□□□ -1.242e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MED15-218ENST00000451058 418 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MED15-216ENST00000445189 596 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 FCHO1-210ENST00000595594 898 ntTSL 316.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 FCHO1-230ENST00000600058 910 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 FCHO1-236ENST00000602111 781 ntTSL 312.7□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GLUL-209ENST00000480604 908 ntTSL 56.65□□□□□ -1.351e-12■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 UQCC1-207ENST00000397553 566 ntTSL 57.22□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MVD-205ENST00000562981 537 ntTSL 214.5□□□□□ -0.098e-14■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.231e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CDK2-208ENST00000555408 2598 ntTSL 39.85□□□□□ -0.831e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 PIK3C2A-205ENST00000533645 2101 ntTSL 59.57□□□□□ -0.883e-10■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.075e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.125e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.595e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-205ENST00000467213 2782 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.655e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-208ENST00000488864 2415 ntTSL 210.65□□□□□ -0.75e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CHD1L-210ENST00000622533 2937 ntTSL 59.76□□□□□ -0.855e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 ID2-204ENST00000472142 474 ntTSL 2-0.2□□□□□ -2.442e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 PLD2-209ENST00000575246 2278 ntTSL 29.76□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.588e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -28e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.18e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLR1A-204ENST00000424089 576 ntTSL 38.03□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLR1A-208ENST00000486964 1427 ntTSL 57.45□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 212.57□□□□□ -0.44e-27■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 KANSL2-206ENST00000548147 1514 ntTSL 27.41□□□□□ -1.226e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 KANSL2-211ENST00000549574 1625 ntTSL 56.16□□□□□ -1.426e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.099e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.129e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.449e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-216ENST00000550184 1564 ntTSL 512.19□□□□□ -0.469e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.579e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.679e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-212ENST00000548725 582 ntTSL 210.81□□□□□ -0.689e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.699e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.149e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-206ENST00000547408 683 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.159e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-214ENST00000549392 411 ntTSL 57.54□□□□□ -1.29e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.329e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 35.98□□□□□ -1.459e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.459e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.69e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 222.03■■□□□ 1.125e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 221.86■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 321.38■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 517.03■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-213ENST00000605202 651 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 HDLBP-244ENST00000490697 581 ntTSL 415.11■□□□□ 0.011e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 513.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLE2-210ENST00000556584 1568 ntTSL 513.14□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 512.91□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-204ENST00000518546 746 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-212ENST00000605178 565 ntTSL 411.83□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 311.57□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-209ENST00000604585 1781 ntTSL 511.53□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 211.48□□□□□ -0.575e-11■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 311.43□□□□□ -0.587e-14■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-207ENST00000519926 857 ntTSL 310.57□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-211ENST00000605069 558 ntTSL 410.55□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-212ENST00000521898 344 ntTSL 59.82□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 59.61□□□□□ -0.879e-8■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-216ENST00000605543 3010 ntTSL 28.6□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 38.42□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 WDR11-201ENST00000263461 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 YEATS2-204ENST00000472593 5737 ntTSL 27.52□□□□□ -1.212e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 CENPE-203ENST00000503705 3468 ntTSL 27.23□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-203ENST00000517297 927 ntTSL 1 (best)7.13□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 HERC2-209ENST00000567869 3523 ntTSL 26.72□□□□□ -1.332e-13■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 LYPLA1-211ENST00000521856 764 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 RARS2-203ENST00000493269 346 ntTSL 26.36□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 29.8
PRPF8Q6P2Q9 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1221 ms