Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms