Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC9A4Q6AI14 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC9A4Q6AI14 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms