Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ANKRD40Q6AI12 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ANKRD40Q6AI12 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms