Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP188Q5SRE5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms