Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RFTN2Q52LD8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RFTN2Q52LD8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms