Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC96Q2M329 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms