Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC27Q2M243 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms