Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSPP1Q1MSJ5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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