Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UPP1Q16831 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UPP1Q16831 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms