Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2B3Q16720 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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