Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SGCBQ16585 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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