Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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SSX1Q16384 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSX1Q16384 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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